植物生物学网址导航

本页面汇集常用植物生物学相关数据库与资源平台，方便快速访问与检索。

网站列表

网站名称	介绍
JGI Phytozome	整合大量植物基因组数据，统一注释分析，助力精准的比较基因组研究
PCMD	植物比较代谢组数据库，涵盖530种植物代谢谱分析数据，提供物种比较、代谢物富集分析等在线工具
EnsemblPlants	Ensembl旗下植物子数据库，可借助BioMart实现植物基因ID转换
PlantTFDB	绿色植物转录因子专属数据库，界面简洁，支持TF ID、名称搜索及序列BLAST查询
PRGdb	植物抗性基因数据库，收录病原体识别基因相关信息，助力植物防御机制研究
TAIR	模式植物拟南芥的遗传与分子生物学数据库，提供全基因组序列、基因产物、遗传标记等信息
CottonMD	棉花专属多组学资源平台，整合基因组、表观基因组等多组学数据，配备多种分析工具
RAP-db	水稻注释数据库，支持基因分布查看、功能序列查询、同源基因BLAST搜索及基因ID转换
BRAD	十字花科植物基因组资源综合数据库，提供基因注释、BLAST等基础服务，还有微共线性分析、引物设计等特色功能
MaizeGDB	玉米专属信息服务数据库，为玉米相关研究提供全面数据支撑
PCMDB	植物细胞marker数据库，收录6种模式植物的三类细胞标记基因相关数据
scPlantDB	植物单细胞综合数据库，收录17个物种的67个单细胞转录组数据集，可分析细胞标记基因表达与功能
Plant Single Cell Hub (PsctH)	植物单细胞综合数据库，提供全面的植物细胞标记资源和专业分析流程
Published Plant Genomes	植物基因组测序数据库，专门收集已测序植物信息，可通过发表时间轴查看相关物种数据
PubPlant	持续更新的已测序与已发表植物基因组资源，提供系统发育位置、时间轴及可下载名录
PlantGIR	全面收集已发表植物基因组数据的综合数据库
国家水稻数据中心	以水稻为核心的专业数据库，涵盖种质、突变体、分子标记、基因信息等数据，服务水稻育种研究

分类索引

基因组与比较基因组

• JGI Phytozome、EnsemblPlants、TAIR、RAP-db、BRAD、MaizeGDB、Published Plant Genomes、PubPlant、PlantGIR

代谢与功能

• PCMD、PlantTFDB、PRGdb

单细胞与细胞标记

• PCMDB、scPlantDB、Plant Single Cell Hub (PsctH)

物种专项

• CottonMD（棉花）、TAIR（拟南芥）、RAP-db（水稻）、BRAD（十字花科）、MaizeGDB（玉米）、国家水稻数据中心（水稻）

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